GENOMER : Plateforme de génomique
Description

Type d'entité Plate-forme
Activité générale La plateforme Genomer développe des applications autour de thématiques environnementales : l'analyse de la diversité infraspécifique (génomique des populations, découverte de SNPs, génotypage haut débit), la génomique et la transcriptomique. Au-delà du séquençage massif, la plateforme est impliquée dans le développement de protocoles liés aux spécificités des modèles marins.
Après formation, les utilisateurs ont accès en autonomie à nos équipements de pointe.

Plateforme Biogenouest.
Mots-clefs ADN, ARN, metagenomique, métatranscriptomique, séquençage haut-débit, NGS, amplicons, génotypage, environnement
Labels Biogenouest
IBiSA
Infrastructure de Recherche (I.R.) du MESRI
EMBRC-France
EMBRC-ERIC
Site internet Plug in labs Ouest
Entités rattachées
Analyseur de fragments applied 3130xl
Bioanalyzer
Covaris M220
Labchip GXT
Lecteur de plaque Spark
Lightcycler 480
MiNion
MiSeq
Pippin prep
Qubit 2.0

Services
Mise à disposition d'équipement (MAD)
Production de banques
Réalisation de séquençage haut débit
Propriété de / opéré par
Site internet Station Biologique Roscoff
Localisation et contact
TANGUY Gwenn Envoyer un email
Adresse Place Georges Teissier
Complément d'adresse Station Biologique de Roscoff - CS 90077
Code postal 29680
Commune ROSCOFF
Services
Mise à disposition d'équipement (MAD)
Publics concernés Partenaires de recherche
Modalités d'accès Environné
Libre
Mobile ? oui non
Description La plate-forme GENOMER met à disposition de l'utilisateur des équipements. Certains équipements nécessitent une habilitation avant toute utilisation. Elle est dispensée par le personnel de la plate-forme après formation de l'utilisateur
Production de banques
Publics concernés Entreprises
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Modalités d'accès Collaboration de recherche
Prestation complète
Environné
Mobile ? oui non
Description Conduite de projet en génomique (CPG) assurée par le personnel, préparation de vos échantillons et production de banque en amont du séquençage haut-débit. a plate-forme Genomer est ouverte à la communauté scientifique de Biogenouest, et, plus largement, aux laboratoires académiques Français et étrangers. Après analyse de la « Fiche Contact » complétée et discussion avec l'utilisateur, la faisabilité du projet est examinée par l'équipe de la plateforme Genomer
Réalisation de séquençage haut débit
Publics concernés Entreprises
Partenaires de recherche
Autres chercheurs
Tous publics
Administrations
Autres
Modalités d'accès Collaboration de recherche
Prestation complète
Environné
Mobile ? oui non
Description Conduite de projet en génomique (CPG) assurée par le personnel comprenant le séquençage haut-débit de vos échantillons. La plate-forme Genomer est ouverte à la communauté scientifique de Biogenouest, et, plus largement, aux laboratoires académiques Français et étrangers. Après analyse de la « Fiche Contact » complétée et discussion avec l'utilisateur, la faisabilité du projet est examinée par l'équipe de la plateforme Genomer
Description
Certification, normalisation, calibration Démarche qualité
Catégories Analyses, essais à terre et sites de tests pour l'ingénierie et l'observation des océans
Analyses, mesures et métrologie
Autre(s) catégorie(s)
Disciplines scientifiques Biologie moléculaire / Biologie cellulaire
Génomique / Génétique
Domaines d'action stratégiques Environnement et valorisation du littoral
Ressources biologiques marines
Exemples de travaux Réseau européen ASSEMBLE+. Projet IDEALG. Dittami et al. (2016). Host-microbe interactions as a driver of acclimatation to saliny gradients in brown algam cultures. The ISME Journal 10, 51-63.
URL travaux
Propriété de / opéré par
Site internet Station Biologique Roscoff
La Station Biologique de Roscoff est un centre de recherche et d'enseignement en biologie et écologie marines . Elle dépend du Cnrs et de Sorbonne Université
Imprimer
REJOIGNEZ-NOUS
Mentions légales | Contact | ©Azimut | Créateur de solutions numériques